2021
03-10
03-10
详解R语言中的PCA分析与可视化
1.常用术语(1)标准化(Scale)如果不对数据进行scale处理,本身数值大的基因对主成分的贡献会大。如果关注的是变量的相对大小对样品分类的贡献,则应SCALE,以防数值高的变量导入的大方差引入的偏见。但是定标(scale)可能会有一些负面效果,因为定标后变量之间的权重就是变得相同。如果我们的变量中有噪音的话,我们就在无形中把噪音和信息的权重变得相同,但PCA本身无法区分信号和噪音。在这样的情形下,我们就不必做定标。(2...
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